Маркировкой лучше заняться сразу, ещё до первых продаж. У знакомого магазин небольшой, но всё равно пришлось подключаться к системе и наносить коды на часть товаров.

Советую сразу разобраться с системой Честный знак и СУЗ, потому что через неё идёт работа с кодами маркировки и документами по товарам. Лучше заранее понять, как всё устроено, чтобы потом не переделывать карточки и учёт. Тут, кстати, подробно расписано, что такое СУЗ и для чего он нужен https://www.cleverence.ru/articles/auto-busines/suz-vse-o-tom-chto-eto-takoe-stantsiya-upravleniya-zakazami-chestnogo-znaka .